首都医科大学有2个校区，分别是校本部、燕京医学院。
首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，已故著名泌尿外科专家、两院院士、全国人大常委会副委员长吴阶平教授为首任校长。现任党委书记李明教授，校长吕兆丰教授。学校校本部设有10所学院和1所研究院。
首都医科大学校区及地址
丰台校区：北京市丰台区右安门外西头条10号
首都医科大学基础医学院：五年制基础医学专业、七年制临床医学专业、七年制临床医学专业(儿科医学专业方向)、七年制口腔医学专业、五年制本科临床医学专业、五年制本科口腔医学专业、五年制本科基础医学专业
燕京医学院：大东路4号。
首都医科大学燕京医学院位于风景优美的北京市顺义区潮白河畔。燕京医学院的前身是北京医学高等专科学校，在卫生部原部长崔月犁同志的倡议下，学校于1985年开始筹建首都医科大学燕京医学院，于1987年3月经国家卫生部和北京市教委批准并报国家教育部备案正式成立
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