黑龙江中医药大学有1个校区，黑龙江中医药大学本部。
黑龙江中医药大学始建于1954年，经六十年的建设与发展，学校已成为具有较高教学、科研、医疗水平，在国内外有一定影响的高等中医药院校，现为黑龙江省重点建设的高水平大学。2008年被确定为国家中医临床研究基地建设单位，2009年和被评为全国精神文明建设工作先进单位。
黑龙江中医药大学本部。位于香坊区和平路24号。
据1月学校官网信息显示，学校下设11个学院、11个附属医院(9个非直属);设有21个本科专业、10个专科专业(方向)，涵盖医、理、文、工、管、法等多个学科门类。其中直属附属医院为黑龙江中医药大学附属第一医院和黑龙江中医药大学附属第二医院。
院系设置
| 基础医学院 | 药学院 | 临床医学院（附属第一医院） |
| 针灸推拿学院（附属第二医院） | 成人教育学院 | 国际教育学院 |
| 人文与管理学院 | 马克思主义学院 | 佳木斯学院 |
| 研究生院 |
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