东南大学双一流学科有12个，名单分别为机械工程、材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、风景园林学、艺术学理论。
| 序号 | 双一流学科名单 |
| 1 | 机械工程 |
| 2 | 材料科学与工程 |
| 3 | 电子科学与技术 |
| 4 | 信息与通信工程 |
| 5 | 控制科学与工程 |
| 6 | 计算机科学与技术 |
| 7 | 建筑学 |
| 8 | 土木工程 |
| 9 | 交通运输工程 |
| 10 | 生物医学工程 |
| 11 | 风景园林学 |
| 12 | 艺术学理论 |
| 序号 | 学校 | 双一流建设学科 |
| 1 | 南京大学 | 哲学、理论经济学、中国语言文学、外国语言文学、物理学、化学、天文学、大气科学、地质学、生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、矿业工程、环境科学与工程、图书情报与档案管理 |
| 2 | 苏州大学 | 材料科学与工程 |
| 3 | 东南大学 | 机械工程、材料科学与工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、风景园林学、艺术学理论 |
| 4 | 南京航空航天大学 | 力学、控制科学与工程、航空宇航科学与技术 |
| 5 | 南京理工大学 | 兵器科学与技术 |
| 6 | 中国矿业大学 | 矿业工程、安全科学与工程 |
| 7 | 南京邮电大学 | 电子科学与技术 |
| 8 | 河海大学 | 水利工程、环境科学与工程 |
| 9 | 江南大学 | 轻工技术与工程、食品科学与工程 |
| 10 | 南京林业大学 | 林业工程 |
| 11 | 南京信息工程大学 | 大气科学 |
| 12 | 南京农业大学 | 作物学、农业资源与环境 |
| 13 | 南京医科大学 | 公共卫生与预防医学 |
| 14 | 南京中医药大学 | 中药学 |
| 15 | 中国药科大学 | 中药学 |
| 16 | 南京师范大学 | 地理学 |
东南大学（Southeast University），简称“东大”，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，是国家首批世界一流大学建设高校（A类）、“985工程”和“211工程”重点建设高校，入选“2011计划”、“111计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、国家大学生创新性实验计划、国家级大学生创新创业训练计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、全国深化创新创业教育改革示范高校、学位授权自主审核单位，由教育部与江苏省共建。
1902年，三江师范学堂创办。1921年，以南京高等师范学校为基础建立国立东南大学，下设工科，其后工科又经历国立第四中山大学工学院、国立中央大学工学院、国立南京大学工学院等历史时期；1952年，以原南京大学工学院为主体，并入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等学校的有关系科，在中央大学本部原址建立南京工学院；1988年5月，学校复更名为东南大学；2000年4月，原东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并，南京地质学校并入，组建新的东南大学。
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